凌卫明带领海州卫徐强一千人、盖州卫冯习一千人，乘坐水军大小船只一百五十艘，在夜间出发。于凌晨悄无声息地抵达登州外围。

叛军于两日前撤围，城中百姓被围月余，一开城门，进进出出的转移家产，收拢难民，极为繁忙。

凌卫明得知后大骂孙元化笨蛋：“真是个老实人啊，打仗还心疼百姓，要是进来些许细作，看你如何应对？”

及至下午，城上发起警报声，急忙关闭城门，叛军已经兵临城下。

孔有德早就派遣数百人装成难民进城，内有耿仲明与都司陈光福及杜承功、曹德纯、吴进兴等十五人为内应。

在登州城内，混乱如汹涌潮水般蔓延开来。叛军的内应隐匿于难民之中，突然扯着嗓子高呼：“叛军进城了，快跑呀！”

那声音瞬间划破了原本紧张压抑的空气。难民们本就惊弓之鸟，闻此呼喊，恐慌如瘟疫般迅速传播，他们像没头的苍蝇般四处躲藏，慌乱中与迎面而来的支援兵力猛烈相撞。

支援的官兵们被这突如其来的人潮冲击得阵脚大乱，队伍瞬间被冲散得七零八落。

此时，内应趁乱掏出火铳，“砰砰砰”地朝着天空开枪。官兵们望着城内上千难民，个个面露难色，手中虽握着武器，却因投鼠忌器而不知所措。

内应们瞅准时机，迅速靠近城门，与守军展开了激烈厮杀。杀散了守军后，众人齐心协力，将沉重的城门缓缓拉开。

孔有德率领骑兵，突入城内，与守军展开了殊死的搏杀。

孙元化那精锐的火器部队虽拼死抵抗，然而叛军人数众多，他们渐渐寡不敌众。战场上硝烟弥漫，喊杀声震天动地，火器部队的士兵们一个个倒下，大部被杀。

葡萄牙教官们也深陷绝境，他们奋勇作战，最终战死 12 人，重伤 15 人，其余皆被俘虏。