刘裕趁机和各路军队一起进攻，顺利地用火攻把桓玄的守军打得大败，桓玄一看情况不妙，弃城往西跑了。

公元404年三月，刘裕进驻石头城，派冠军将军刘毅、辅国将军何无忌、振武将军刘道规率领各军去追桓玄。

王谧等人一起推举刘裕兼任扬州刺史，刘裕呢，却一个劲儿地推辞。最后，王谧担任录尚书事，兼任扬州刺史。

而刘裕则被推举为使持节、都督扬徐兖豫青冀幽并八州诸军事、领军将军、徐州刺史。

东晋末年，那政局乱得一塌糊涂，百官行事放纵，各行各业都荒废了。

刘裕以身作则，先用威严约束宫廷内外，嘿，这一来，百官都开始认真干活了，就这么两三天，朝廷的风气就彻底变了样。您瞧瞧，这刘裕是不是很有一套！

刘裕一当政，头一个整治的对象，就是那腐朽不堪的门阀。

刘裕掌权之后，直接就对反对自己的“江左冠族”动手了。

这“江左冠族”里的尚书左仆射王愉，还有他儿子、荆州刺史王绥，这王绥还是桓氏的亲党呢，就这么被刘裕给诛杀了。

不光如此，还有光禄勋丁承之、左卫将军褚粲以及游击将军司马秀，他们仨干了个“役使官人”的事儿，被御史中丞王祯之给揭发了。这三人呢，在给朝廷的谢罪文书里，还满是怨言。

刘裕知道后，就向司马遵奏报，说他们“无端生出怨恨，还把责任推给有关部门”，就这么着，把这三人全部免了官。

到了四月，刘裕尊奉武陵王司马遵为大将军，以他的名义大赦天下，不过呢，桓玄那一族可不在赦免范围内，其他人都赦免了。