其实准噶尔汗国也看上了伊犁，原本巴图尔珲台吉是不打算把伊犁让出去的，无奈顺军一再要求伊犁这地方必须归顺军所有，巴图尔珲台吉最终没有办法，只能同意。

从大顺坚持想要伊犁这件事，巴图尔珲台吉也陡然发现大顺对于西域确实还是相当了解的，不然不会眼光如此精准地锁定了伊犁这个地方，这让他叹了口气，心想看来以后没有机会耍小心思了。

不过和叶尔羌汗国的安排一样，顺军承诺顺军只要伊犁这个地方，伊犁城中的财富人口则归准噶尔所有，顺军不会过问。

伊犁可是个富庶的好地方，想到伊犁城中那些财富，准噶尔士兵个个士气高涨，况且他们有顺军这个后台，所有出征的准噶尔士兵都认为这场仗准噶尔必胜无疑。

气势汹汹杀向伊犁的准噶尔军队让驻守的叶尔羌军队压力倍增，但叶尔羌军队也不想轻易放弃伊犁：

放弃伊犁意味着叶尔羌汗国将彻底失去北疆，这是叶尔羌汗国所不愿意看到的。

而且以准噶尔人的那副德行，一旦城破，伊犁怕是会被准噶尔人完全洗劫一空。

所以，叶尔羌守军也打起十二分精神，一方面赶紧派人去通知阿不都拉汗，一方面又动员民众上城墙协防，打造守城器械，准备和准噶尔军队死磕。

伊犁城中的军民颇有些军民同心的意思，在他们的奋力作战之下，准噶尔军队多次猛攻都被叶尔羌守军顽强的打退。

加上准噶尔军队缺少重火器，他们强攻多次无果之后只能改强攻为围困，准备硬耗下去，或者说迫使伊犁保持这种神经紧张的氛围，直到顺军大军赶到。

另一边的叶尔羌军队虽然多次挡住准噶尔军队的猛攻，到自身损失也不小，在准噶尔军队的围困之下士气低迷。

最终，随着第一批大顺军队赶到伊犁，叶尔羌守军心里风险崩溃，最终伊犁还是没能挡住准噶尔军队的攻势，在坚守良久之后被准噶尔军队攻陷。。