张太医等人阴谋败露后，涉事太医很快受到了严厉的惩罚。皇上龙颜大怒，下令将张太医及其党羽打入大牢，家产全部充公。他们在狱中悔恨交加，但为时已晚。

太医院在叶尘的主导下，展开了全面的整顿。叶尘深知，这是一次彻底改变太医院面貌的绝佳机会，他必须全力以赴。

首先，叶尘重新审视了太医院的人员结构。对于那些曾经与张太医同流合污，但情节较轻且有悔改之意的太医，叶尘给予了他们一定的警告和观察期。而对于那些顽固不化、不知悔改的太医，叶尘则毫不留情地将他们逐出了太医院。

“太医院乃是救死扶伤之地，容不得丝毫的私心和恶行。”叶尘在全院大会上严肃地说道。

为了提高太医们的医术水平，叶尘制定了严格的培训和考核制度。他邀请了各地的名医前来授课，分享最新的医学知识和临床经验。同时，他还要求太医们定期进行医术交流和案例研讨。

“我们必须不断学习和进步，才能更好地应对各种病症，为患者解除痛苦。”叶尘鼓励太医们积极进取。

在药材管理方面，叶尘更是下了大功夫。他亲自监督药材的采购，确保每一味药材都货真价实。同时，他还建立了严格的药材入库和出库登记制度，杜绝了任何可能的药材克扣和浪费现象。

“药材是治病的关键，一丝一毫都不能马虎。”叶尘对负责药材的人员再三强调。

在整顿的过程中，叶尘也遇到了不少阻力和困难。一些被处罚的太医心怀怨恨，试图暗中破坏整顿工作。他们散布谣言，说叶尘独断专行，打压异己。

“哼，这些人不知悔改，还妄图抹黑我。”叶尘心中虽然愤怒，但他知道不能被这些谣言所干扰。

叶尘决定以实际行动来回应这些谣言。他亲自为一些疑难杂症患者诊治，展现出了高超的医术和仁心。患者们对他感激涕零，称赞他是神医。